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專利基本信息
專利名稱 靶向生物毒素的G-四聯(lián)體式核酸適配體三級結構預測方法
專利狀態(tài) - 專利號(申請?zhí)枺?/th> CN110718265B
專利申請日期 2019-09-05 專利類型 發(fā)明專利
申請公布號 2019108351386 申請公布日 2019-09-05
授權公告號 - 授權公告日 -
發(fā)明人 黃強;劉建平;章琪;李干;宋夢華
專利權人 復旦大學
專利摘要 本發(fā)明屬于核苷酸三級結構預測技術領域,具體為一種靶向生物毒素的G?四聯(lián)體式核酸適配體三級結構預測方法。本發(fā)明方法包括:G?四聯(lián)體二級結構預測;G?四聯(lián)體三級拓撲構型預測;核酸適配體末端補全和結構優(yōu)化;溫度依賴型分子動力學模擬(包括兩個過程:恒溫分子動力學模擬和升溫分子動力學模擬);采用RMSD分析方法獲得最穩(wěn)定核酸三級結構模型。本發(fā)明方法已用于預測靶向膝溝藻毒素的特異性核酸適配體序列GO18?T?d的三級結構,該序列為已知的通過指數(shù)富集配基進化技術篩選得到G?四聯(lián)體式適配體序列,通過圓二色譜實驗檢測到其G?四聯(lián)體構型為平行式G?四聯(lián)體構型,預測結果與圓二色譜實驗檢測結果完全吻合,證明本預測方法具有良好的準確性。
專利價值評估分析
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