| 專利名稱 | 靶向生物毒素的G-四聯(lián)體式核酸適配體三級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法 | ||
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| 專利狀態(tài) | - | 專利號(申請?zhí)枺?/th> | CN110718265A |
| 專利申請日期 | 2019-09-05 | 專利類型 | 發(fā)明專利 |
| 申請公布號 | 2019108351386 | 申請公布日 | 2019-09-05 |
| 授權(quán)公告號 | - | 授權(quán)公告日 | - |
| 發(fā)明人 | 黃強;劉建平;章琪;李干;宋夢華 | ||
| 專利權(quán)人 | 復(fù)旦大學(xué) | ||
| 專利摘要 | 本發(fā)明屬于核苷酸三級結(jié)構(gòu)預(yù)測技術(shù)領(lǐng)域,具體為一種靶向生物毒素的G?四聯(lián)體式核酸適配體三級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法。本發(fā)明方法包括:G?四聯(lián)體二級結(jié)構(gòu)預(yù)測;G?四聯(lián)體三級拓?fù)錁?gòu)型預(yù)測;核酸適配體末端補全和結(jié)構(gòu)優(yōu)化;溫度依賴型分子動力學(xué)模擬(包括兩個過程:恒溫分子動力學(xué)模擬和升溫分子動力學(xué)模擬);采用RMSD分析方法獲得最穩(wěn)定核酸三級結(jié)構(gòu)模型。本發(fā)明方法已用于預(yù)測靶向膝溝藻毒素的特異性核酸適配體序列GO18?T?d的三級結(jié)構(gòu),該序列為已知的通過指數(shù)富集配基進(jìn)化技術(shù)篩選得到G?四聯(lián)體式適配體序列,通過圓二色譜實驗檢測到其G?四聯(lián)體構(gòu)型為平行式G?四聯(lián)體構(gòu)型,預(yù)測結(jié)果與圓二色譜實驗檢測結(jié)果完全吻合,證明本預(yù)測方法具有良好的準(zhǔn)確性。 | ||
